昆明医科大学海源学院于2001年由昆明医科大学联合昆明富达实业集团创办，2004年通过教育部首批审核，确认为独立学院，是云南省唯一一所医药卫生类独立学院。2013年通过省教育厅对独立学院首批教学工作评估；2015年民办本科院校办学水平评估中获A等；2023年在省属民办高校办学情况评估中名列前茅。先后被评为云南省优秀普通高等学校、云南省民办教育示范高校、云南省文明学校、云南省委组织部“两新”组织党建工作示范点、云南省大学生就业工作先进单位等。
学校高新、杨林两校区办学，设有党政管理机构14个，党总支11个，教学及辅助机构13个，群团机构3个，实验实训机构20个，其中省级实验教学示范中心1个、省级虚拟仿真实验教学中心2个。两校区总占地面积698.21亩，建筑面积540844.23平方米；图书馆馆藏图书资源总量122.9695万册；在职在岗教职工743人，其中专任教师659人，专任教师中具有副高及以上职称教师260人，具有硕士及以上学历346人；自有非直属附属医院3所（昆明医科大学海源学院附属石林天奇医院、附属昆明同仁医院、附属富民医院）；教学医院3所（昆明市妇幼保健院、禄丰县人民医院、昆明安琪儿妇产科医院）；实践教学基地112个。
学校面向全国31个省市区、直辖市招生，截至2024年3月，全日制本科在校生15871人。设有临床医学、口腔医学、护理学、药学、眼视光学等22个本科专业，涵盖医学、理学、工学、管理学、教育学共5个学科门类，其中医学检验技术专业为争创国内一流备案专业，此外，护理学专业为省级一流专业建设点，临床医学、护理学、药学、口腔医学4个专业为省级特色专业，医学影像技术、康复治疗学、运动康复、公共事业管理4个专业为院级特色专业，形成了以省级特色专业为引领，院级特色专业为支撑的专业建设体系。